Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd35E9Q9D8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms