Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp31E9Q6Y8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms