Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D8

C6, Complement component 6, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6E9Q6D8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6E9Q6D8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C6E9Q6D8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms