Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700024B05RikE9Q6D7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms