Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DspE9Q557 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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