Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tarbp1E9Q368 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tarbp1E9Q368 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms