Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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