Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd2E9PZM4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms