Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gcom1E9PZ54 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms