Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms