Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3bE9PUL3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms