Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cngb1E1AZ71 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms