Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms