Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms