Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
3425401B19RikD3Z1D3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
3425401B19RikD3Z1D3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms