Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc6D3YZP9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms