Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn24D3YXJ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn24D3YXJ9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms