Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rexo5D3YW29 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms