Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmf1B9EKI3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms