Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cttnbp2B9EJA2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms