Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm20547B8JJN0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms