Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf11cB4XVP9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms