Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms