Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usf3B2RUQ2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usf3B2RUQ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usf3B2RUQ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usf3B2RUQ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usf3B2RUQ2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usf3B2RUQ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf3B2RUQ2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms