Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms