Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r5B2RQT2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms