Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms