Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brpf3B2KF05 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms