Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms