Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms