Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr29B1ARI9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms