Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms