Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf39A2RT81 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms