Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AgrnA2ASQ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AgrnA2ASQ1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms