Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtcflA2APF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtcflA2APF3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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