Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll9A2APC3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms