Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox3fA2ANE1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms