Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Shroom2A2ALU4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom2A2ALU4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom2A2ALU4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms