Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Frmpd1A2AKB4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms