Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm11A2AGX3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm11A2AGX3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms