Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap5A2AGT5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap5A2AGT5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms