Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm884A2A9H6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm884A2A9H6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms