Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Szt2A2A9C3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Szt2A2A9C3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms