Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm27029A2A4P4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm27029A2A4P4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms