Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71e1A1L3C1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71e1A1L3C1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms