Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc112A0AUP1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms