Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms