Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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