Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms