Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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